MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331 chromosome

Total Repeats: 56359

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_013124	TCCG	2	8	175329	175336	0 %	25 %	25 %	50 %	256370985
4502	NC_013124	TTCG	2	8	175363	175370	0 %	50 %	25 %	25 %	256370985
4503	NC_013124	CGG	2	6	175390	175395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370985
4504	NC_013124	AGACG	2	10	175396	175405	40 %	0 %	40 %	20 %	256370985
4505	NC_013124	TGC	2	6	175422	175427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370985
4506	NC_013124	CGA	2	6	175431	175436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370985
4507	NC_013124	GTC	2	6	175453	175458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370985
4508	NC_013124	TCCACG	2	12	175536	175547	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	256370985
4509	NC_013124	CCGA	2	8	175556	175563	25 %	0 %	25 %	50 %	256370985
4510	NC_013124	GTC	2	6	175574	175579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370985
4511	NC_013124	GAG	2	6	175580	175585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256370985
4512	NC_013124	GCT	2	6	175681	175686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370985
4513	NC_013124	ACC	2	6	175695	175700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256370985
4514	NC_013124	CG	3	6	175745	175750	0 %	0 %	50 %	50 %	256370986
4515	NC_013124	CGG	2	6	175787	175792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370986
4516	NC_013124	GA	3	6	175808	175813	50 %	0 %	50 %	0 %	256370986
4517	NC_013124	GTC	2	6	175833	175838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370986
4518	NC_013124	CGA	2	6	175850	175855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370986
4519	NC_013124	CGA	2	6	175865	175870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370986
4520	NC_013124	CGC	2	6	175910	175915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370986
4521	NC_013124	GCT	2	6	175939	175944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370986
4522	NC_013124	TGA	2	6	175949	175954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256370986
4523	NC_013124	GGCT	2	8	175974	175981	0 %	25 %	50 %	25 %	256370986
4524	NC_013124	GAC	2	6	175989	175994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370986
4525	NC_013124	GTCG	2	8	176042	176049	0 %	25 %	50 %	25 %	256370986
4526	NC_013124	CAGC	2	8	176102	176109	25 %	0 %	25 %	50 %	256370986
4527	NC_013124	GGC	2	6	176151	176156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370986
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4529	NC_013124	TGG	2	6	176309	176314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256370986
4530	NC_013124	AGC	2	6	176320	176325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370986
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4532	NC_013124	CGA	2	6	176414	176419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370986
4533	NC_013124	CAGCG	2	10	176430	176439	20 %	0 %	40 %	40 %	256370986
4534	NC_013124	GCG	2	6	176488	176493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370986
4535	NC_013124	TGT	2	6	176619	176624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_013124	TCG	2	6	176626	176631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4537	NC_013124	GTG	2	6	176647	176652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_013124	GCGA	2	8	176699	176706	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4539	NC_013124	ATC	2	6	176743	176748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4540	NC_013124	TGG	2	6	176784	176789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_013124	GTC	2	6	176792	176797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4542	NC_013124	CG	3	6	176828	176833	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4543	NC_013124	GCT	2	6	176840	176845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370987
4544	NC_013124	CG	3	6	176846	176851	0 %	0 %	50 %	50 %	256370987
4545	NC_013124	GTCG	2	8	176884	176891	0 %	25 %	50 %	25 %	256370987
4546	NC_013124	GAT	2	6	177053	177058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256370987
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4552	NC_013124	CGC	2	6	177169	177174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370987
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4555	NC_013124	GAG	2	6	177368	177373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256370987
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4557	NC_013124	TCG	2	6	177420	177425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370987
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4559	NC_013124	GTC	2	6	177456	177461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370987
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4562	NC_013124	CG	4	8	177520	177527	0 %	0 %	50 %	50 %	256370987
4563	NC_013124	GCT	2	6	177568	177573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370987
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4603	NC_013124	GTCG	2	8	179089	179096	0 %	25 %	50 %	25 %	256370988
4604	NC_013124	G	6	6	179096	179101	0 %	0 %	100 %	0 %	256370988
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4742	NC_013124	ACCA	2	8	184848	184855	50 %	0 %	0 %	50 %	256370993
4743	NC_013124	GC	4	8	184883	184890	0 %	0 %	50 %	50 %	256370993
4744	NC_013124	CTC	2	6	184899	184904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256370993
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4746	NC_013124	CGT	2	6	184982	184987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370993
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4752	NC_013124	GTC	2	6	185154	185159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370993
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4761	NC_013124	GGA	2	6	185333	185338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256370994
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4789	NC_013124	GAG	2	6	186350	186355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4843	NC_013124	CTCG	2	8	188811	188818	0 %	25 %	25 %	50 %	256370999
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4858	NC_013124	GC	3	6	189407	189412	0 %	0 %	50 %	50 %	256370999
4859	NC_013124	CGA	2	6	189425	189430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370999
4860	NC_013124	CGTGG	2	10	189453	189462	0 %	20 %	60 %	20 %	256370999
4861	NC_013124	GTC	2	6	189490	189495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370999
4862	NC_013124	TCG	2	6	189502	189507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370999
4863	NC_013124	GC	5	10	189518	189527	0 %	0 %	50 %	50 %	256370999
4864	NC_013124	CTG	2	6	189528	189533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370999
4865	NC_013124	TCT	2	6	189550	189555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256370999
4866	NC_013124	GTCG	2	8	189605	189612	0 %	25 %	50 %	25 %	256370999
4867	NC_013124	CGT	2	6	189613	189618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370999
4868	NC_013124	GGTG	2	8	189791	189798	0 %	25 %	75 %	0 %	256371000
4869	NC_013124	TGG	2	6	189840	189845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256371000
4870	NC_013124	CG	3	6	189853	189858	0 %	0 %	50 %	50 %	256371000
4871	NC_013124	CCT	2	6	189883	189888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256371000
4872	NC_013124	GAC	2	6	189949	189954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371000
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4874	NC_013124	CTC	2	6	189989	189994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256371000
4875	NC_013124	CGG	2	6	190030	190035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371000
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4878	NC_013124	TCG	2	6	190209	190214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371000
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4880	NC_013124	CCT	2	6	190375	190380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256371000
4881	NC_013124	GCG	2	6	190394	190399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371000
4882	NC_013124	CGA	2	6	190447	190452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371000
4883	NC_013124	CTG	2	6	190456	190461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371000
4884	NC_013124	CG	3	6	190498	190503	0 %	0 %	50 %	50 %	256371000
4885	NC_013124	GGC	2	6	190532	190537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371000
4886	NC_013124	CGC	2	6	190600	190605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256371000
4887	NC_013124	CGT	2	6	190613	190618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371000
4888	NC_013124	ACG	2	6	190626	190631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371000
4889	NC_013124	TGG	2	6	190738	190743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4890	NC_013124	ATGG	2	8	190778	190785	25 %	25 %	50 %	0 %	256371001
4891	NC_013124	CGA	2	6	190795	190800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371001
4892	NC_013124	GCT	2	6	190801	190806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371001
4893	NC_013124	CTC	2	6	190819	190824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256371001
4894	NC_013124	CG	3	6	190842	190847	0 %	0 %	50 %	50 %	256371001
4895	NC_013124	CGT	3	9	190865	190873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371001
4896	NC_013124	CGAGC	2	10	191026	191035	20 %	0 %	40 %	40 %	256371001
4897	NC_013124	CG	3	6	191046	191051	0 %	0 %	50 %	50 %	256371001
4898	NC_013124	CAG	2	6	191083	191088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371001
4899	NC_013124	TCGG	2	8	191146	191153	0 %	25 %	50 %	25 %	256371001
4900	NC_013124	TCG	2	6	191185	191190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371001
4901	NC_013124	GCAG	2	8	191244	191251	25 %	0 %	50 %	25 %	256371001
4902	NC_013124	GC	3	6	191260	191265	0 %	0 %	50 %	50 %	256371001
4903	NC_013124	GCTCA	2	10	191311	191320	20 %	20 %	20 %	40 %	256371001
4904	NC_013124	GGC	2	6	191394	191399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371001
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4909	NC_013124	CTA	2	6	191565	191570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256371001
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4911	NC_013124	CTG	2	6	191671	191676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371001
4912	NC_013124	GCTG	2	8	191683	191690	0 %	25 %	50 %	25 %	256371001
4913	NC_013124	GGC	2	6	191756	191761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4914	NC_013124	GC	4	8	191792	191799	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4915	NC_013124	GAG	2	6	191823	191828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4916	NC_013124	GTG	2	6	191873	191878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256371002
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4918	NC_013124	GGGCGC	2	12	191940	191951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371002
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4920	NC_013124	GGT	2	6	192051	192056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256371002
4921	NC_013124	GC	3	6	192107	192112	0 %	0 %	50 %	50 %	256371002
4922	NC_013124	CGT	2	6	192197	192202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371003
4923	NC_013124	GCT	2	6	192205	192210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371003
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4927	NC_013124	GTC	2	6	192345	192350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371003
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4933	NC_013124	GCGA	2	8	192720	192727	25 %	0 %	50 %	25 %	256371003
4934	NC_013124	TCG	2	6	192746	192751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371003
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4936	NC_013124	CCGCG	2	10	192848	192857	0 %	0 %	40 %	60 %	256371003
4937	NC_013124	TG	3	6	192904	192909	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4938	NC_013124	GGT	2	6	192916	192921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4939	NC_013124	AGT	2	6	192943	192948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4940	NC_013124	GTG	2	6	193033	193038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4941	NC_013124	CGA	2	6	193066	193071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371004
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4943	NC_013124	GAG	2	6	193130	193135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256371004
4944	NC_013124	CG	3	6	193170	193175	0 %	0 %	50 %	50 %	256371004
4945	NC_013124	CGC	2	6	193229	193234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256371004
4946	NC_013124	TGA	2	6	193264	193269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256371004
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4948	NC_013124	GC	3	6	193312	193317	0 %	0 %	50 %	50 %	256371004
4949	NC_013124	CGA	3	9	193327	193335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371004
4950	NC_013124	CGA	2	6	193351	193356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371004
4951	NC_013124	CGCC	2	8	193390	193397	0 %	0 %	25 %	75 %	256371004
4952	NC_013124	GTC	2	6	193439	193444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371004
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4958	NC_013124	TGA	2	6	193627	193632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256371005
4959	NC_013124	CCG	2	6	193686	193691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256371005
4960	NC_013124	GAG	3	9	193709	193717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256371005
4961	NC_013124	CGA	2	6	193759	193764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371005
4962	NC_013124	GGT	2	6	193772	193777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256371005
4963	NC_013124	CGT	2	6	193786	193791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371005
4964	NC_013124	ATG	2	6	193803	193808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256371005
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4966	NC_013124	GTC	2	6	193894	193899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371005
4967	NC_013124	GAG	2	6	193909	193914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256371005
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4969	NC_013124	GTA	2	6	193965	193970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256371006
4970	NC_013124	CGA	2	6	193976	193981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371006
4971	NC_013124	CAG	2	6	193986	193991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371006
4972	NC_013124	TCGT	2	8	194025	194032	0 %	50 %	25 %	25 %	256371006
4973	NC_013124	GAA	2	6	194049	194054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256371006
4974	NC_013124	AGG	2	6	194095	194100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256371006
4975	NC_013124	TGG	2	6	194152	194157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256371006
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4977	NC_013124	GGA	2	6	194249	194254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256371006
4978	NC_013124	GC	4	8	194293	194300	0 %	0 %	50 %	50 %	256371006
4979	NC_013124	GC	3	6	194308	194313	0 %	0 %	50 %	50 %	256371006
4980	NC_013124	AGCCGG	2	12	194319	194330	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	256371006
4981	NC_013124	CCT	2	6	194354	194359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256371007
4982	NC_013124	ACC	2	6	194362	194367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256371007
4983	NC_013124	TGC	2	6	194371	194376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371007
4984	NC_013124	GTC	2	6	194382	194387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256371007
4985	NC_013124	CGA	2	6	194389	194394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371007
4986	NC_013124	CCGG	2	8	194571	194578	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4987	NC_013124	CGT	2	6	194616	194621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4988	NC_013124	GTG	2	6	194624	194629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4989	NC_013124	GAG	2	6	194757	194762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256371008
4990	NC_013124	GCCGC	2	10	194822	194831	0 %	0 %	40 %	60 %	256371008
4991	NC_013124	CGG	2	6	194839	194844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256371008
4992	NC_013124	GC	3	6	194862	194867	0 %	0 %	50 %	50 %	256371008
4993	NC_013124	GAG	2	6	194893	194898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256371008
4994	NC_013124	GCGG	2	8	194949	194956	0 %	0 %	75 %	25 %	256371008
4995	NC_013124	CGA	2	6	194987	194992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371008
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4999	NC_013124	GCA	2	6	195119	195124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256371008
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